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宋任涛教授实验室在玉米蛋白品质研究上取得重要进展

创建时间:  2015/04/08  王伟   浏览次数:   

太阳成集团tyc33455cc宋任涛教授实验室最近在玉米蛋白品质的研究上取得重要进展,相关研究结果发表在植物学顶级学术期刊Plant Cell(五年平均影响因子10.65)。

玉米主要用作饲料,但是玉米在蛋白品质上存在很大的缺陷,主要表现在缺乏赖氨酸等必需氨基酸。上世纪60年代,发现了一个重要的高赖氨酸突变体Opaque2,可以修复玉米蛋白品质上的缺陷。然而Opaque2突变体还影响了很多其他的农艺性状,在实际的育种应用中存在很多困难。虽然Opaque2基因在1987年被克隆,发现它编码一个转录调控因子。但随后的几十年的研究并没有搞清Opaque2具体调控哪些基因,以及其复杂表型性状的分子本质。

宋任涛课题组针对Opaque2突变体,开展了RNA测序和染色质免疫沉淀(ChIP)测序,发现Opaque2突变后影响了约1600个基因的表达;作为转录因子,Opaque2直接结合在约1100个基因序列上。进一步分析表明有35个基因是Opaque2直接调控的靶标基因,并通过功能分析确定了多个新的醇溶蛋白基因、转录因子、逆境相关基因等是新的靶标基因。这一研究还给出了一个分层调控的模型,解释了Opaque2突变造成的多效性的生物学效应。这个工作是玉米蛋白品质研究的一个重要进展,已经在线发表在植物学顶级期刊Plant Cell上(http://www.plantcell.org/content/early/2015/02/17/tpc.114.134858.full.pdf+html),并被编辑选为In Brief,撰写了题为Clarifying the opaque: identification of direct targets of maize Opaque2的推荐介绍(http://www.plantcell.org/content/early/2015/02/24/tpc.15.00156.full.pdf+html)。

这个成果的第一作者分别是宋任涛教授的博士生李朝斌、乔祯逸同学,以及青年教师祁巍巍博士。研究得到国家杰出青年科学基金、科技部973计划等资助。这是宋任涛教授实验室自2012年以来,在玉米蛋白品质研究上连续发表的第三篇Plant Cell论文。

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