近日,《自然•通讯》以"Design and fabrication of flexible DNA polymer cocoons to encapsulate live cells"为题发表了我校太阳成集团tyc33455cc李根喜教授课题组在细胞组装方面的最新研究成果(Nature Communications, 2019, 10: 2946, DOI: 10.1038/s41467-019-10845-2)
细胞组装与包裹是生物传感、组织工程、细胞移植与治疗等领域的关键技术,同时,对包裹细胞的精准操控是实现多类型、多层次细胞有序组装的重要基础,也是后续生物医学应用研究的关键技术瓶颈。因此,发展功能可调、精准可控的细胞组装与包裹方法是多个研究领域的迫切需求。
图1. 基于原位DNA导向分子聚合反应(in situ DNA-oriented polymerization, isDOP)的单细胞包裹。该方法适用于多种细胞类型的包裹,包括细菌、酵母和哺乳动物等细胞。
日前,我校太阳成集团tyc33455cc李根喜教授课题组提出了一种基于生物合成方法的原位、程序化和生物相容的细胞包裹方法,该方法利用天然的DNA聚合反应在细胞表面原位合成与编织DNA高分子聚合物,从而在细胞周围组装成"茧"状的DNA网络分子结构(如图1)。该方法通过先后引入一对特异的DNA引物,协调两组滚环扩增(RCA)反应R1和R2,从而在细胞表面扩增出两种串联重复的长单链DNA作为编织材料(如图2)。基于配对规则,并通过设计模板和引物,使扩增出的长单链DNA实现相互交叉与编织,最终在细胞表面形成网络状结构。借助高度可控的DNA聚合反应以及DNA分子精准配对的特性,该方法可以对细菌、酵母、哺乳动物细胞等多种类型的细胞进行包裹;并且可以通过调节特异RCA引物的表面密度和反应浓度,实现细胞表面DNA"茧"多个特性的调控。
图2. 两组协同的RCA扩增反应在细胞表面形成DNA网络结构。
该方法相对于其它细胞包裹技术具备独特的优势:1)DNA聚合反应及其产物的生物相容性为细胞包裹提供了有利的环境;2)DNA材料高度可调的特性(核苷酸类似物、类磷酸骨架、DNA修饰酶等)为包裹层多种特性的引入提供了广泛的空间和可能;3)精准的DNA碱基配对可实现分子水平的组装和操控,为细胞的精准操作提供了基础。基于上述特性,该研究基于DNA分子特性,对包裹的细胞进行DNA编码,实现了包裹细胞的精准捕获与分选,如(图3),为将来多种应用(如细胞作用网络的调控、干细胞功能调控、组织再生工程等)创造了条件。
图3.基于限制性内切酶的细胞DNA"茧"编辑与细胞精准操作。
该成果于7月3日在《自然•通讯》公开发表,论文第一作者是我校博士后高涛(现为南京师范大学副教授),李根喜教授是论文的通讯作者。研究工作得到了国家博士后创新人才支持计划项目、国家自然科学基金面上及重点项目的支持。